Масару Даймон – мальчик, который учится в средней школе. Он много времени проводит на улице, занимаясь боями. Масарц даже прозвал себя самым лучшим бойцом в Японии, которого невозможно победить. Именно во время очередного поединка он знакомится в Агумоном. Новых друг совсем недавно сбежал из секретной правительственной организации, которая занимается слежкой и поимкой опасных дигимонов.
Они сбегают из своего Цифрового мира, но сотрудники службы стараются восстановить баланс и вернуть из на место. Тогда Масару предложили стать частью этой секретной организации и помогать в поимке дигимонов. Мальчик с новым другом стараются защитить город от нападений противников. В это время дигимоны стали чаще терроризировать людей.
